Существует взаимосвязь возникновения дисциркуляторных явлений в вертебрально-базилярном бассейне в зависимости от уровня поражения позвоночной артерии. При поражении верхней трети артерии, дисциркуляция локализована в самом стволе позвоночной артерии, до места её слияния, в основную артерию, с артерией другой стороны. При поражении средней трети позвоночной артерии, спазмированными оказываются дистальные ветви позвоночной и основной артерии.

При поражении нижней трети позвоночной артерии наибольшее расстройство кровотока отмечено в самых дистальных ветвях вертебрально-базилярной системы.

На основе обширного клиникорентгенологического материала Я Ю. Попелянский, И. Р. Шмидт, делают вывод о том, что синдром позвоночной артерии является ведущим неврологическим проявлением врождённых блоков шейных позвонков.

По их наблюдениям, чаще блокируются второй и третий шейные позвонки, сочетаясь с другими аномалиями и оставаясь длительное время клинически латентными.