Среди этиопатогенетических факторов в возникновении КВА ведущее место занимают генетические и врождённо обусловленные.

Наряду с этим существует мнение о роли застарелой травмы верхнешейного отдела позвоночника и родовой травмы новорожденных. Базилярное вдавление — одна из наиболее часто упоминаемых в литературе краниовертебральных аномалий. Впервые базилярное вдавление было описано Колумбом и Аккерманом в 1790 году, а впоследствие Бергом и Ретциусом.

Оно представляет собой выпячивание в полость черепа краёв затылочной кости, образующих большое затылочное отверстие, что изменяет форму и уменьшает размеры задней черепной ямки. Часто при базилярном вдавлении зуб эпистрофея проникает в большое затылочное отверстие.

При базилярном вдавлении приподнимается и нижний край Блюменбахова ската.

В выраженных случаях скат принимает горизонтальное положение, создавая впечатление уплощения основания черепа — платибазия.

При этом боковые отделы средней черепной ямки находятся на одном уровне с задней черепной ямкой.